Фемінотека була заснована в 2001 році як перша феміністична книгарня онлайн-крамниця і культурний веб-сайт у Центральній та Східній Європі. У 2005 році її було перетворено на фонд. Його ініціаторкою і засновницею є Йоанна Піотровська, педагогиня, тренерка WenDo та експертка з протидії насильству над жінками.
У перші роки нашої діяльності ми мали справу з широким розумінням проблеми гендерної дискримінації. „Trudne wyrazy – odzyskajmy kobiety w języku”(Важкі вирази – віднайдемо жінок у мові) – перша акція фонду, проведена у 2005 році. Ми використовували її для просування жіночих відповідників чоловічих назв професій чи функцій. Акцію організовано у співпраці з „Wysokie Obcasy”.
Протягом кількох років ми вели проєкти, пов’язані з дискримінацією на ринку праці, створили віртуальний музей історії жінок, проводили антидискримінаційні тренінги та майстер-класи. Однак щоразу виявлялося, що чи не в кожній сфері діяльності Фемінотеки найбільшою проблемою є насильство над жінками, особливо сексуальне.
У 2009 році ми вирішили відкрити гарячу лінію для жінок, які зазнали насильства, і наша діяльність стала все більше зосереджуватися на цій темі. Особливою сферою інтересів і діяльності завжди було сексуальне насильство – ми готували доповіді, публікації та дискусії на цю тему. Ми також відкрили спеціальний Фонд для жінок, які пережили зґвалтування, завдяки якому ми можемо швидко надати підтримку тим, хто цього потребує.
У 2013 році Фемінотека взялася за організацію та координацію міжнародної кампанії One Billion Rising у Польщі, ініційованої Евою Енслер – американською активісткою та авторкою «Монологів вагіни». Акція була присвячена проблемі сексуального насильства над жінками. Результатом акції стало створення Жіночої мережі проти насильства – групи місцевих лідерок та активісток проти насильства.
У 2022 році через повномасштабну війну в Україні ми відкрили притулок для жінок з досвідом насильства та поширили свою діяльність на біженок.
У 2023 році ми відкрили в Польщі перший Пункт допомоги жінкам після зґвалтування за зразком (та у співпраці) пунктів з Ірландії та Великої Британії, де вони працюють уже 40 років.